Wakati mfumo wa CNC umewashwa, vipunguzi vinavyohitajika hupangwa kwenye programu na kuagizwa kwa zana na mashine zinazolingana, ambazo hufanya kazi za ukubwa kama ilivyobainishwa, kama vile roboti.

Katika upangaji wa programu ya CNC, jenereta ya msimbo ndani ya mfumo wa nambari mara nyingi itachukulia kuwa mifumo haina dosari, licha ya uwezekano wa hitilafu, ambayo ni kubwa zaidi wakati mashine ya CNC inapoelekezwa kukata zaidi ya mwelekeo mmoja kwa wakati mmoja.Uwekaji wa zana katika mfumo wa udhibiti wa nambari umeainishwa na safu ya pembejeo inayojulikana kama programu ya sehemu.

Kwa mashine ya kudhibiti nambari, programu zinaingizwa kupitia kadi za punch.Kwa kulinganisha, programu za mashine za CNC hutolewa kwa kompyuta kupitia kibodi ndogo.Upangaji wa CNC huhifadhiwa kwenye kumbukumbu ya kompyuta.Nambari yenyewe imeandikwa na kuhaririwa na watengeneza programu.Kwa hivyo, mifumo ya CNC inatoa uwezo mkubwa zaidi wa kukokotoa.Zaidi ya yote, mifumo ya CNC haijatulia hata kidogo kwa vile vidokezo vipya zaidi vinaweza kuongezwa kwa programu zilizokuwepo awali kupitia msimbo uliorekebishwa.